非課税運用しようと思うと、従業員負担があるし、給料から天引きされるのを嫌がる社員がいるんじゃないか？

確かに一部そういった社員様もいらっしゃるとは思いますが、割合として1～2割程度で少数ですし、周りの社員様が利用されているのを見て、後でお申込みをされる方も多いです。