YMM4を開くと、ときおりバージョンアップの案内が表示されて、更新かキャンセルを選ぶようになります。 一度更新した際、霊夢と魔理沙の設定が振り出しに戻ってしまったため、それ以降は、怖いのでキャンセルを選んでいます。 更新した方が良いのでしょうか？

割と頻繁にアップデートありますよね。 僕の場合はキャラ設定がリセットされた経験がないのですが、その経験は一度だけでしょうか？ 設定し直すのは大変だと思いますので、毎回リセットされるようでしたら頻繁にしなくても大丈夫です。 ただ、たまに仕様が少しずつ変わることもあるので、問題が発生しないようでしたら更新することをおすすめします。